Itinatala ng LabDAO ang Hinaharap ng Open-Source AI Para sa Pagtuklas ng Droga

Ang proyekto ng Folding@home ay naging mga headline sa buong pandemya ng COVID-19 para sa pag-aayos ng hindi nagamit na kapangyarihan sa pag-compute upang galugarin ang puwang sa paghahanap ng folding ng protina upang harapin ang nobelang coronavirus. Sa pagbibigay kapangyarihan sa mga mamamayan na maging mga siyentipiko sa kanilang sariling karapatan, ang inisyatiba ay nagpatakbo ng malakihang simulation ng iba't ibang molecular configuration ng mga protina sa isang distributed network ng "naka-enroll" na mga computer sa buong mundo.

Ang desentralisadong paradigm na ito ay ipinahayag para sa pagsasama-sama ng mga tao sa isang karaniwang problema at mahusay na pag-compute ng crowd-sourcing, ngunit paano kung ang computing power at imprastraktura sa paglutas ng problema ay baligtad? Sa madaling salita, paano kung ang mga indibidwal ay maaaring magpatakbo ng kanilang sariling mga proyekto sa pamamagitan ng pag-tap sa naipon na kapangyarihan sa pag-compute at ang mga tool para sa biological experimentation para mag-boot?

Ginagawa ng LabDAO na isang katotohanan ang pangarap na iyon gamit ang PLEX Platform nito. Ang PLEX ay isang open-source na command line tool na idinisenyo upang gawing hindi lamang ang mga mapagkukunan sa pag-compute kundi pati na rin ang iba't ibang mga tool sa pag-aaral ng biological-machine (na nabuo ang "BioML" suite sa loob ng LabDAO) na naa-access sa iba't ibang background. Mag-eksperimento man sa maliit na molecule docking o protein folding simulation ng sarili, binibigyang-daan ng PLEX ang mga user na mag-tap sa library ng mga tool ng LabDAO, magbahagi ng mga resulta, at mailarawan ang mga ito sa loob ng wala pang limang minuto.

Ang hanay ng mga tool na ito at ang platform na nagpapagana sa paggamit nito sa itaas nito ay ipinakita sa Blockchain Meets Biology summit ng Zuzalu noong unang bahagi ng Abril, kung saan ipinakita ng miyembro ng LabDAO Core Team na si Lily Hansen-Gillis mula simula hanggang matapos ang isang simulation ng internal molecular dynamics ng isang protina upang mahanap ang pinaka-matatag na pagsasaayos nito. Pagkatapos, bilang isang self-professed "non-coder," dinala niya ang audience sa pamamagitan nito mula simula hanggang katapusan—lahat ay may computer, WiFi, PLEX sa command line, at wala nang iba pa.

Sa mas malawak na paraan, ang LabDAO ay isang web3-enabled na desentralisadong platform (bahagi ng mas malaking "DeSci" na kilusan) na nakatuon sa paglikha ng isang mas produktibong kapaligiran para sa open source-powered na pagtuklas ng gamot. Sa pamamagitan ng paggawa ng mga tool at mapagkukunan sa cutting edge na magagamit sa isang mas malawak na ecosystem, nilalayon ng LabDAO na lumikha ng tamang kapaligiran para sa mga transparent at naa-access na mga pagsulong sa siyensya. Sa pamamagitan man ng pag-aalis ng pangangailangan para sa mga mananaliksik na magkaroon ng kanilang sariling hardware o imprastraktura sa pag-compute o pag-publish ng mga resulta ng mga eksperimento sa isang blockchain ledger na ang mga ito ay naaayon at nagagawang muli, ang organisasyon ay nakatuon na gawing posible ang higit pang pagbabago sa pamamagitan ng pakikipagtulungan — pagsira sa mga hadlang na dulot ng mahihirap. usability at siloed, niche expertise.

Ang mga pagsisikap ng LabDAO na buuin ang DeSci na mundo ng hinaharap para sa ngayon ay nakatanggap kamakailan ng tulong sa anyo ng $3.6 milyon na round ng pagpopondo mula sa iba't ibang DAO, Inflection.xyz, Balaji Srinivasan, at iba pa. Ang pag-agos ng suporta na ito ay mag-aambag sa patuloy na pagsisikap na bumuo ng mga open-source na tool ng software at palakasin ang research ecosystem ng LabDAO.

Tulad ng para sa PLEX mismo, ang mga agarang susunod na hakbang sa abot-tanaw ay kinabibilangan ng pagsubok sa platform sa iba't ibang pang-agham na pakikipagtulungan, paglalagay ng iba't ibang mga tool, at pag-iipon ng kinakailangang hardware upang mapaunlad ang network ng BioML.

Para sa pangmatagalan, marahil ang susunod na gamot na nagliligtas-buhay sa susunod na pangunahing pagsiklab ng nakakahawang sakit ay idinisenyo gamit ang kapangyarihan ng PLEX, isang desentralisadong hakbang pasulong sa isang pagkakataon. Habang patuloy na lumalaki ang ecosystem, oras lang ang magsasabi.

Salamat sa Aishani Aatresh para sa karagdagang pananaliksik at pag-uulat sa artikulong ito. Ako ang nagtatag ng SynBioBeta, at ang ilan sa mga kumpanyang isinusulat ko ay mga sponsor ng Kumperensya ng SynBioBeta. Para sa higit pang nilalaman, maaari kang mag-subscribe sa ang aking lingguhang newsletter.